Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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RxraP28700 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RxraP28700 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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RxraP28700 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RxraP28700 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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