Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Defa2P28309 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms