Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ggta1P23336 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms