Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Eif3aP23116 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eif3aP23116 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms