Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SftpcP21841 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms