Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TP20293 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TP20293 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TP20293 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TP20293 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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