Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18529 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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P18529 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
P18529 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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P18529 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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P18529 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
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P18529 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
P18529 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
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P18529 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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P18529 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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P18529 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
P18529 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
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