Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18528 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
P18528 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
P18528 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
P18528 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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P18528 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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P18528 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
P18528 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
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