Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hoxb1P17919 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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