Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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