Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
DmdP11531 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
DmdP11531 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
DmdP11531 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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