Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fv4P11370 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms