Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
UbbP0CG49 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms