Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC8.8□□□□□ -1
PtprqP0C5E4 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms