Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfrbP05622 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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PdgfrbP05622 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PdgfrbP05622 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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