Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
E2f6O54917 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms