Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChkaO54804 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ChkaO54804 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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