Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atf6bO35451 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atf6bO35451 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atf6bO35451 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Atf6bO35451 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Atf6bO35451 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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