Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm20939L7N243 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms