Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm2888K7N746 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms