Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm2035J3QP87 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms