Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tubgcp6G5E8P0 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp6G5E8P0 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tubgcp6G5E8P0 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms