Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm28048F7BCN0 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm28048F7BCN0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm28048F7BCN0 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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