Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Tacc2-203ENSMUST00000084513 9029 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Vpreb3D3Z6J4 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Vpreb3D3Z6J4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms