Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms