Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SafbD3YXK2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SafbD3YXK2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms