Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rd3lB2RV38 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms