Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms