Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Prrt4B2RU40 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Prrt4B2RU40 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms