Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprsB0V2N1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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PtprsB0V2N1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PtprsB0V2N1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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