Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M5A7VMS3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms