Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ckap5A2AGT5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ckap5A2AGT5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ckap5A2AGT5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ckap5A2AGT5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms