Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lrit3W8DXL4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lrit3W8DXL4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lrit3W8DXL4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms