Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top3bQ9Z321 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top3bQ9Z321 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top3bQ9Z321 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms