Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mbd1Q9Z2E2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mbd1Q9Z2E2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mbd1Q9Z2E2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms