Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Mbd3Q9Z2D8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms