Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccne2Q9Z238 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccne2Q9Z238 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccne2Q9Z238 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms