Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip6Q9Z1Y4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip6Q9Z1Y4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip6Q9Z1Y4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms