Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ilf3Q9Z1X4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ilf3Q9Z1X4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms