Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D17h6s53eQ9Z1R4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms