Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Arid3bQ9Z1N7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Arid3bQ9Z1N7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arid3bQ9Z1N7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.6 ms