Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp4Q9Z1N6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms