Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nek4Q9Z1J2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nek4Q9Z1J2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nek4Q9Z1J2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms