Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf394Q9Z1D9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Znf394Q9Z1D9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Znf394Q9Z1D9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms