Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sumo3Q9Z172 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sumo3Q9Z172 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms