Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cpne6Q9Z140 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cpne6Q9Z140 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cpne6Q9Z140 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms