Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3bp5Q9Z131 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3bp5Q9Z131 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3bp5Q9Z131 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms