Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hmg20bQ9Z104 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hmg20bQ9Z104 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hmg20bQ9Z104 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms