Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp2Q9Z0E6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gbp2Q9Z0E6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gbp2Q9Z0E6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms