Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PapolbQ9WVP6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PapolbQ9WVP6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms